电影《名侦探柯南 灰原哀物语～黑铁的神秘列车～》以灰原哀的视角展开。她本是黑衣组织成员雪莉，因姐姐被杀而叛逃，变小后寄宿在阿笠博士家。某天，她受邀乘坐豪华列车“黑铁之星”，却意外发现组织成员也在车上。神秘事件接连发生：乘客离奇失踪、尸体出现。灰原哀意识到这是组织的陷阱，她与柯南联手调查，在列车疾驰中上演生死追逐。影片深入剖析灰原哀的内心挣扎与对光明的渴望，同时展现她与组织间的宿命对决。真相令人震惊，结局催人泪下。