在碧蓝的海洋深处，一场无声的危机正在蔓延——珊瑚礁正遭受破坏性生物的侵袭！海底小纵队紧急集结，队长巴克带领呱唧、皮索等队员，驾驶章鱼堡前往现场。他们发现大量长棘海星正在疯狂啃食珊瑚，导致生态失衡。小纵队决定采用生物防治法，引入海星的天敌大法螺，同时用特制隔离网保护未受损的珊瑚。过程中，突遇暗流冲击，皮索险些被卷走，幸好被突突兔的机械臂及时救回。最终，在队员们的默契配合下，珊瑚礁恢复生机，各种海洋生物重新得到庇护。影片寓教于乐，科普了珊瑚保护的重要性，呼吁孩子们珍惜海洋家园。