法医林夜（化名）因一起离奇命案被卷入黑暗旋涡。死者表面是车祸，但尸检揭示其体内藏有罕见的深海毒素，指向一个跨国走私团伙。林夜在深夜潜入太平间，用激光扫描发现死者骨骼上的生物标记，竟与十年前失踪的海洋科学家吻合。他联合记者小陈追踪线索，遭遇神秘人追杀。在废弃码头，林夜利用化骨水还原被销毁的尸骸，揭露团伙利用深海生物提取违禁药物的惊天阴谋。真相浮出水面时，林夜发现凶手就在身边——竟是警局高层为掩盖旧案而灭口。最终，他在直播中公开证据，将罪犯绳之以法，自己却因违规解剖面临处分。影片以法医箱在夜雨中打开的特写结尾，暗示正义虽迟但到。