在第三季中，克拉克·肯特（Clark Kent）继续在都市中平衡记者身份与超人的秘密使命。这一季，新反派“影渊”（Shadow Abyss）现身，拥有操控阴影的能力，将大都会陷入永恒的黑暗。超人必须与露易丝·莱恩（Lois Lane）和盟友合作，揭露影渊背后的阴谋——原来他是一位被实验扭曲的前科学家。同时，莱克斯·卢瑟（Lex Luthor）在暗中策划利用影渊的力量实现他的统治计划。超人在一场场激战中学会借助太阳能量对抗阴影，最终在正义联盟的帮助下击败强敌，守护了城市的光明。