《深夜航班第二季》延续第一季悬疑风格，讲述一班午夜航班在万米高空遭遇超自然现象。机舱内时间陷入循环，乘客不断重复同一段对话，而窗外出现诡异的红色云团。乘务员发现乘客名单上多出一个不存在的人，且所有通讯设备失灵。主角们必须在下一轮循环开始前破解谜题，否则将永远被困在无尽的黑暗中。剧情紧凑，反转不断，结局留下巨大悬念。