在东京的月光下，一场连环杀人案悄然展开，受害者身上均留有神秘的音符印记。柯南与灰原哀联手调查，发现线索指向一位失聪的天才钢琴师，他利用次声波杀人并制造完美不在场证明。随着调查深入，柯南逐渐接近真相，却意外发现凶手竟与黑衣组织有牵连。在最终的对决中，柯南借助少年侦探团的帮助，通过一场露天音乐会的高潮演奏，破译了音符中的密码，成功将凶手绳之以法。影片融合了古典音乐与推理元素，情节紧张而富有节奏感，展现了柯南的智慧与勇气。